MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 chromosome

Total Repeats: 46192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011296	GTG	2	6	45	50	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206889903
2	NC_011296	AAC	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889903
3	NC_011296	A	6	6	97	102	100 %	0 %	0 %	0 %	206889903
4	NC_011296	A	6	6	125	130	100 %	0 %	0 %	0 %	206889903
5	NC_011296	TGGT	2	8	151	158	0 %	50 %	50 %	0 %	206889903
6	NC_011296	T	6	6	165	170	0 %	100 %	0 %	0 %	206889903
7	NC_011296	CCT	2	6	209	214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206889903
8	NC_011296	CTG	2	6	321	326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206889903
9	NC_011296	TAG	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889903
10	NC_011296	A	6	6	483	488	100 %	0 %	0 %	0 %	206889903
11	NC_011296	TAA	2	6	489	494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889903
12	NC_011296	AGT	2	6	526	531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889903
13	NC_011296	AGA	2	6	622	627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889903
14	NC_011296	A	6	6	663	668	100 %	0 %	0 %	0 %	206889903
15	NC_011296	A	6	6	682	687	100 %	0 %	0 %	0 %	206889903
16	NC_011296	AT	3	6	696	701	50 %	50 %	0 %	0 %	206889903
17	NC_011296	TAA	2	6	718	723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889903
18	NC_011296	ATG	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889903
19	NC_011296	GAA	2	6	791	796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889903
20	NC_011296	GAA	2	6	803	808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889903
21	NC_011296	A	7	7	811	817	100 %	0 %	0 %	0 %	206889903
22	NC_011296	TA	4	8	882	889	50 %	50 %	0 %	0 %	206889903
23	NC_011296	TAA	2	6	928	933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889903
24	NC_011296	AT	3	6	983	988	50 %	50 %	0 %	0 %	206889903
25	NC_011296	TGG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206889903
26	NC_011296	A	6	6	1088	1093	100 %	0 %	0 %	0 %	206889903
27	NC_011296	TAA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889903
28	NC_011296	GAA	2	6	1148	1153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889903
29	NC_011296	TAT	2	6	1228	1233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889903
30	NC_011296	A	6	6	1257	1262	100 %	0 %	0 %	0 %	206889903
31	NC_011296	TGA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889903
32	NC_011296	A	6	6	1375	1380	100 %	0 %	0 %	0 %	206889903
33	NC_011296	T	6	6	1408	1413	0 %	100 %	0 %	0 %	206890635
34	NC_011296	TCC	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890635
35	NC_011296	AT	3	6	1467	1472	50 %	50 %	0 %	0 %	206890635
36	NC_011296	TATG	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	206890635
37	NC_011296	CTT	2	6	1551	1556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890635
38	NC_011296	AAGAGA	2	12	1607	1618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890635
39	NC_011296	TCA	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	206890635
40	NC_011296	T	8	8	1678	1685	0 %	100 %	0 %	0 %	206890635
41	NC_011296	GGA	2	6	1701	1706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206890635
42	NC_011296	A	6	6	1726	1731	100 %	0 %	0 %	0 %	206890635
43	NC_011296	CTT	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890635
44	NC_011296	AAAATA	2	12	1807	1818	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	206890635
45	NC_011296	TCTT	2	8	1838	1845	0 %	75 %	0 %	25 %	206890635
46	NC_011296	TGGA	2	8	1991	1998	25 %	25 %	50 %	0 %	206890635
47	NC_011296	GCT	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890635
48	NC_011296	ATA	2	6	2022	2027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890635
49	NC_011296	ATA	2	6	2055	2060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890635
50	NC_011296	AG	3	6	2079	2084	50 %	0 %	50 %	0 %	206890635
51	NC_011296	GAAG	2	8	2085	2092	50 %	0 %	50 %	0 %	206890635
52	NC_011296	AAG	2	6	2111	2116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890635
53	NC_011296	AATC	2	8	2138	2145	50 %	25 %	0 %	25 %	206890635
54	NC_011296	TA	3	6	2154	2159	50 %	50 %	0 %	0 %	206890635
55	NC_011296	TAA	2	6	2165	2170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890635
56	NC_011296	AGA	2	6	2171	2176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890635
57	NC_011296	TCT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890635
58	NC_011296	ATG	2	6	2203	2208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890635
59	NC_011296	GCA	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890635
60	NC_011296	ATTCCT	2	12	2256	2267	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	206890635
61	NC_011296	ATA	2	6	2313	2318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890635
62	NC_011296	TGA	2	6	2533	2538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890766
63	NC_011296	TGA	2	6	2560	2565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890766
64	NC_011296	AAC	2	6	2622	2627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206890766
65	NC_011296	TTA	2	6	2637	2642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890766
66	NC_011296	CTT	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890766
67	NC_011296	TAT	2	6	2657	2662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890766
68	NC_011296	ATT	2	6	2758	2763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206890766
69	NC_011296	AGCAA	2	10	2776	2785	60 %	0 %	20 %	20 %	206890766
70	NC_011296	AGGAGA	2	12	2901	2912	50 %	0 %	50 %	0 %	206890709
71	NC_011296	CCT	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890709
72	NC_011296	A	8	8	2935	2942	100 %	0 %	0 %	0 %	206890709
73	NC_011296	T	6	6	3007	3012	0 %	100 %	0 %	0 %	206890709
74	NC_011296	ATCA	2	8	3060	3067	50 %	25 %	0 %	25 %	206890709
75	NC_011296	TAG	2	6	3078	3083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890709
76	NC_011296	A	6	6	3084	3089	100 %	0 %	0 %	0 %	206890709
77	NC_011296	GAA	2	6	3098	3103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890709
78	NC_011296	TCC	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	206890709
79	NC_011296	A	6	6	3203	3208	100 %	0 %	0 %	0 %	206890709
80	NC_011296	TC	3	6	3262	3267	0 %	50 %	0 %	50 %	206890709
81	NC_011296	TC	4	8	3278	3285	0 %	50 %	0 %	50 %	206890709
82	NC_011296	A	6	6	3321	3326	100 %	0 %	0 %	0 %	206890709
83	NC_011296	TGG	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890709
84	NC_011296	A	7	7	3376	3382	100 %	0 %	0 %	0 %	206890709
85	NC_011296	TGT	2	6	3548	3553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889259
86	NC_011296	CAA	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889259
87	NC_011296	CAG	2	6	3649	3654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889259
88	NC_011296	CAG	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206889259
89	NC_011296	G	6	6	3715	3720	0 %	0 %	100 %	0 %	206889259
90	NC_011296	T	6	6	3735	3740	0 %	100 %	0 %	0 %	206889259
91	NC_011296	AATG	2	8	3788	3795	50 %	25 %	25 %	0 %	206889259
92	NC_011296	CAAA	2	8	3814	3821	75 %	0 %	0 %	25 %	206889259
93	NC_011296	TTA	2	6	3862	3867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889259
94	NC_011296	TGT	2	6	3920	3925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206889259
95	NC_011296	TCT	2	6	4007	4012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206889259
96	NC_011296	GAA	3	9	4015	4023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889259
97	NC_011296	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889259
98	NC_011296	ATT	2	6	4083	4088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	206889259
99	NC_011296	ATA	2	6	4092	4097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206889259
100	NC_011296	ATG	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206889259
101	NC_011296	AAC	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	206889259
102	NC_011296	GAA	2	6	4380	4385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206889259
103	NC_011296	A	6	6	4405	4410	100 %	0 %	0 %	0 %	206889259
104	NC_011296	A	6	6	4413	4418	100 %	0 %	0 %	0 %	206889259
105	NC_011296	AGA	2	6	4467	4472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
106	NC_011296	AGA	2	6	4496	4501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
107	NC_011296	TGG	2	6	4513	4518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890334
108	NC_011296	TGA	2	6	4626	4631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890334
109	NC_011296	AGA	2	6	4647	4652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
110	NC_011296	GAA	2	6	4656	4661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
111	NC_011296	GA	3	6	4693	4698	50 %	0 %	50 %	0 %	206890334
112	NC_011296	CTT	2	6	4764	4769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890334
113	NC_011296	A	6	6	4788	4793	100 %	0 %	0 %	0 %	206890334
114	NC_011296	GAA	2	6	4868	4873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
115	NC_011296	GTT	2	6	4952	4957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	206890334
116	NC_011296	CAG	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890334
117	NC_011296	AAT	2	6	4998	5003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890334
118	NC_011296	TCT	2	6	5022	5027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	206890334
119	NC_011296	ACTG	2	8	5038	5045	25 %	25 %	25 %	25 %	206890334
120	NC_011296	AATA	2	8	5178	5185	75 %	25 %	0 %	0 %	206890334
121	NC_011296	A	6	6	5185	5190	100 %	0 %	0 %	0 %	206890334
122	NC_011296	ATG	2	6	5266	5271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890334
123	NC_011296	TGG	2	6	5421	5426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890334
124	NC_011296	ATA	2	6	5465	5470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890334
125	NC_011296	ATGGT	2	10	5472	5481	20 %	40 %	40 %	0 %	206890334
126	NC_011296	GAA	2	6	5497	5502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
127	NC_011296	CAG	2	6	5576	5581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	206890334
128	NC_011296	TAA	2	6	5585	5590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	206890334
129	NC_011296	GAA	2	6	5686	5691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	206890334
130	NC_011296	AT	3	6	5697	5702	50 %	50 %	0 %	0 %	206890334
131	NC_011296	TGA	2	6	5739	5744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	206890334
132	NC_011296	AACA	2	8	5756	5763	75 %	0 %	0 %	25 %	206890334
133	NC_011296	CTG	2	6	5766	5771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	206890334
134	NC_011296	GGT	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	206890334
135	NC_011296	GAG	2	6	5822	5827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	206890334
136	NC_011296	AT	3	6	5891	5896	50 %	50 %	0 %	0 %	206890334
137	NC_011296	ACC	2	6	5919	5924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	206890334
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